Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VdrP48281 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VdrP48281 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
VdrP48281 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VdrP48281 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VdrP48281 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VdrP48281 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VdrP48281 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VdrP48281 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VdrP48281 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VdrP48281 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VdrP48281 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VdrP48281 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VdrP48281 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VdrP48281 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VdrP48281 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VdrP48281 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VdrP48281 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VdrP48281 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VdrP48281 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VdrP48281 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VdrP48281 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VdrP48281 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VdrP48281 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VdrP48281 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VdrP48281 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VdrP48281 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VdrP48281 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VdrP48281 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VdrP48281 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VdrP48281 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VdrP48281 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VdrP48281 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VdrP48281 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VdrP48281 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VdrP48281 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VdrP48281 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VdrP48281 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
VdrP48281 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VdrP48281 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VdrP48281 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VdrP48281 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VdrP48281 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VdrP48281 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VdrP48281 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VdrP48281 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VdrP48281 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VdrP48281 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VdrP48281 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
VdrP48281 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
VdrP48281 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
VdrP48281 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VdrP48281 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VdrP48281 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VdrP48281 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VdrP48281 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VdrP48281 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VdrP48281 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VdrP48281 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VdrP48281 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VdrP48281 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VdrP48281 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VdrP48281 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VdrP48281 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VdrP48281 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VdrP48281 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VdrP48281 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
VdrP48281 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VdrP48281 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VdrP48281 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VdrP48281 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VdrP48281 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VdrP48281 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VdrP48281 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VdrP48281 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VdrP48281 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VdrP48281 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VdrP48281 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
VdrP48281 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VdrP48281 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VdrP48281 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VdrP48281 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VdrP48281 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VdrP48281 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VdrP48281 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
VdrP48281 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VdrP48281 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VdrP48281 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VdrP48281 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VdrP48281 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VdrP48281 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VdrP48281 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VdrP48281 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VdrP48281 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VdrP48281 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VdrP48281 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VdrP48281 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VdrP48281 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VdrP48281 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VdrP48281 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms