Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CratP47934 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CratP47934 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CratP47934 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CratP47934 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CratP47934 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CratP47934 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CratP47934 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CratP47934 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CratP47934 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CratP47934 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CratP47934 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CratP47934 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CratP47934 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CratP47934 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CratP47934 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CratP47934 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CratP47934 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CratP47934 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CratP47934 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CratP47934 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CratP47934 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CratP47934 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CratP47934 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CratP47934 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CratP47934 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CratP47934 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CratP47934 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CratP47934 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CratP47934 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CratP47934 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CratP47934 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CratP47934 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CratP47934 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CratP47934 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CratP47934 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CratP47934 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CratP47934 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CratP47934 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CratP47934 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CratP47934 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CratP47934 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CratP47934 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CratP47934 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CratP47934 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CratP47934 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CratP47934 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CratP47934 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CratP47934 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CratP47934 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CratP47934 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CratP47934 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CratP47934 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CratP47934 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CratP47934 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CratP47934 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CratP47934 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CratP47934 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CratP47934 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CratP47934 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CratP47934 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CratP47934 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CratP47934 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CratP47934 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CratP47934 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CratP47934 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CratP47934 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CratP47934 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CratP47934 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CratP47934 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CratP47934 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CratP47934 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CratP47934 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CratP47934 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CratP47934 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CratP47934 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CratP47934 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CratP47934 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CratP47934 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CratP47934 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CratP47934 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CratP47934 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CratP47934 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CratP47934 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CratP47934 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CratP47934 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CratP47934 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CratP47934 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CratP47934 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CratP47934 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CratP47934 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CratP47934 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CratP47934 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CratP47934 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CratP47934 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CratP47934 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CratP47934 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CratP47934 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CratP47934 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CratP47934 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms