Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SrprbP47758 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SrprbP47758 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SrprbP47758 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrprbP47758 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrprbP47758 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SrprbP47758 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SrprbP47758 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SrprbP47758 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrprbP47758 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SrprbP47758 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrprbP47758 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms