Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cdkn1bP46414 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cdkn1bP46414 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cdkn1bP46414 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cdkn1bP46414 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cdkn1bP46414 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cdkn1bP46414 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cdkn1bP46414 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cdkn1bP46414 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cdkn1bP46414 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cdkn1bP46414 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cdkn1bP46414 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cdkn1bP46414 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cdkn1bP46414 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cdkn1bP46414 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cdkn1bP46414 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cdkn1bP46414 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cdkn1bP46414 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cdkn1bP46414 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkn1bP46414 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkn1bP46414 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkn1bP46414 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkn1bP46414 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkn1bP46414 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkn1bP46414 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkn1bP46414 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkn1bP46414 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkn1bP46414 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkn1bP46414 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkn1bP46414 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkn1bP46414 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkn1bP46414 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkn1bP46414 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkn1bP46414 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkn1bP46414 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkn1bP46414 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkn1bP46414 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkn1bP46414 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkn1bP46414 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkn1bP46414 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkn1bP46414 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkn1bP46414 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkn1bP46414 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkn1bP46414 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkn1bP46414 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkn1bP46414 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdkn1bP46414 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cdkn1bP46414 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cdkn1bP46414 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cdkn1bP46414 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cdkn1bP46414 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cdkn1bP46414 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdkn1bP46414 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdkn1bP46414 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdkn1bP46414 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdkn1bP46414 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdkn1bP46414 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdkn1bP46414 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdkn1bP46414 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdkn1bP46414 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdkn1bP46414 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdkn1bP46414 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdkn1bP46414 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdkn1bP46414 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdkn1bP46414 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdkn1bP46414 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdkn1bP46414 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdkn1bP46414 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdkn1bP46414 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdkn1bP46414 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdkn1bP46414 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdkn1bP46414 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkn1bP46414 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkn1bP46414 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkn1bP46414 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkn1bP46414 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkn1bP46414 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkn1bP46414 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkn1bP46414 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkn1bP46414 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkn1bP46414 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkn1bP46414 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkn1bP46414 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkn1bP46414 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkn1bP46414 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkn1bP46414 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkn1bP46414 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkn1bP46414 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkn1bP46414 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkn1bP46414 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkn1bP46414 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkn1bP46414 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkn1bP46414 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkn1bP46414 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkn1bP46414 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdkn1bP46414 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdkn1bP46414 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdkn1bP46414 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdkn1bP46414 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdkn1bP46414 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms