Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfsf4P43488 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms