Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf9P41274 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tnfsf9P41274 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tnfsf9P41274 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf9P41274 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms