Protein–RNA interactions for Protein: P41164

Etv1, ETS translocation variant 1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv1P41164 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Etv1P41164 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Etv1P41164 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Etv1P41164 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Etv1P41164 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Etv1P41164 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Etv1P41164 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Etv1P41164 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Etv1P41164 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Etv1P41164 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Etv1P41164 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Etv1P41164 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Etv1P41164 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Etv1P41164 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Etv1P41164 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Etv1P41164 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Etv1P41164 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Etv1P41164 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Etv1P41164 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Etv1P41164 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Etv1P41164 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Etv1P41164 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Etv1P41164 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Etv1P41164 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Etv1P41164 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Etv1P41164 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Etv1P41164 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Etv1P41164 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Etv1P41164 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Etv1P41164 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Etv1P41164 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Etv1P41164 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Etv1P41164 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Etv1P41164 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Etv1P41164 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Etv1P41164 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Etv1P41164 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Etv1P41164 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Etv1P41164 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Etv1P41164 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Etv1P41164 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Etv1P41164 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Etv1P41164 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Etv1P41164 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Etv1P41164 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Etv1P41164 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Etv1P41164 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Etv1P41164 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Etv1P41164 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Etv1P41164 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Etv1P41164 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Etv1P41164 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Etv1P41164 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Etv1P41164 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Etv1P41164 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Etv1P41164 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Etv1P41164 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Etv1P41164 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Etv1P41164 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Etv1P41164 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Etv1P41164 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Etv1P41164 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Etv1P41164 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Etv1P41164 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Etv1P41164 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Etv1P41164 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Etv1P41164 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Etv1P41164 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Etv1P41164 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Etv1P41164 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Etv1P41164 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Etv1P41164 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Etv1P41164 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Etv1P41164 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Etv1P41164 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Etv1P41164 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Etv1P41164 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Etv1P41164 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Etv1P41164 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Etv1P41164 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Etv1P41164 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Etv1P41164 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Etv1P41164 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Etv1P41164 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Etv1P41164 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Etv1P41164 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Etv1P41164 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Etv1P41164 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Etv1P41164 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Etv1P41164 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Etv1P41164 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Etv1P41164 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Etv1P41164 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Etv1P41164 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Etv1P41164 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Etv1P41164 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Etv1P41164 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Etv1P41164 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Etv1P41164 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Etv1P41164 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms