Protein–RNA interactions for Protein: P40749

Syt4, Synaptotagmin-4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt4P40749 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syt4P40749 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syt4P40749 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syt4P40749 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syt4P40749 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syt4P40749 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syt4P40749 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syt4P40749 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syt4P40749 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms