Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Chd1P40201 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Chd1P40201 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chd1P40201 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chd1P40201 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Chd1P40201 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Chd1P40201 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chd1P40201 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chd1P40201 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chd1P40201 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chd1P40201 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Chd1P40201 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chd1P40201 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms