Protein–RNA interactions for Protein: P40142

Tkt, Transketolase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TktP40142 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TktP40142 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TktP40142 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TktP40142 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TktP40142 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TktP40142 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TktP40142 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TktP40142 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TktP40142 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TktP40142 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TktP40142 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TktP40142 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TktP40142 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TktP40142 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TktP40142 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TktP40142 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TktP40142 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TktP40142 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TktP40142 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TktP40142 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TktP40142 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TktP40142 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TktP40142 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TktP40142 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TktP40142 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TktP40142 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TktP40142 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TktP40142 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TktP40142 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TktP40142 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TktP40142 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TktP40142 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TktP40142 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TktP40142 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TktP40142 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TktP40142 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TktP40142 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TktP40142 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TktP40142 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TktP40142 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TktP40142 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TktP40142 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TktP40142 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TktP40142 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TktP40142 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TktP40142 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TktP40142 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TktP40142 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TktP40142 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TktP40142 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TktP40142 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TktP40142 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TktP40142 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TktP40142 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TktP40142 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TktP40142 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TktP40142 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TktP40142 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TktP40142 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TktP40142 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TktP40142 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TktP40142 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TktP40142 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TktP40142 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TktP40142 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TktP40142 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TktP40142 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TktP40142 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TktP40142 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TktP40142 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TktP40142 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TktP40142 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TktP40142 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TktP40142 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TktP40142 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TktP40142 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TktP40142 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TktP40142 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TktP40142 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TktP40142 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TktP40142 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TktP40142 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TktP40142 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TktP40142 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TktP40142 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TktP40142 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TktP40142 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TktP40142 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TktP40142 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TktP40142 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TktP40142 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TktP40142 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TktP40142 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TktP40142 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TktP40142 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TktP40142 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TktP40142 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TktP40142 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TktP40142 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TktP40142 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms