Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf2P39429 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf2P39429 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf2P39429 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf2P39429 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms