Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Traf1P39428 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Traf1P39428 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf1P39428 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf1P39428 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Traf1P39428 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Traf1P39428 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Traf1P39428 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Traf1P39428 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms