Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TtlP38585 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TtlP38585 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TtlP38585 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TtlP38585 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TtlP38585 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TtlP38585 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TtlP38585 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TtlP38585 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TtlP38585 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TtlP38585 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TtlP38585 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TtlP38585 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TtlP38585 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TtlP38585 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TtlP38585 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TtlP38585 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TtlP38585 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TtlP38585 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TtlP38585 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TtlP38585 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TtlP38585 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TtlP38585 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TtlP38585 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TtlP38585 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TtlP38585 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TtlP38585 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TtlP38585 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TtlP38585 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TtlP38585 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TtlP38585 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TtlP38585 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TtlP38585 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TtlP38585 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TtlP38585 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TtlP38585 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TtlP38585 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TtlP38585 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TtlP38585 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TtlP38585 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TtlP38585 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TtlP38585 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TtlP38585 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TtlP38585 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TtlP38585 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TtlP38585 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TtlP38585 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TtlP38585 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TtlP38585 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TtlP38585 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TtlP38585 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TtlP38585 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TtlP38585 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TtlP38585 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TtlP38585 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TtlP38585 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TtlP38585 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TtlP38585 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TtlP38585 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TtlP38585 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TtlP38585 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TtlP38585 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TtlP38585 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TtlP38585 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TtlP38585 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TtlP38585 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TtlP38585 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TtlP38585 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TtlP38585 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TtlP38585 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TtlP38585 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TtlP38585 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TtlP38585 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TtlP38585 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TtlP38585 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TtlP38585 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TtlP38585 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TtlP38585 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TtlP38585 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TtlP38585 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TtlP38585 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TtlP38585 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TtlP38585 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TtlP38585 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TtlP38585 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TtlP38585 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TtlP38585 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TtlP38585 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TtlP38585 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TtlP38585 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TtlP38585 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TtlP38585 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TtlP38585 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TtlP38585 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TtlP38585 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TtlP38585 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TtlP38585 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TtlP38585 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TtlP38585 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TtlP38585 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms