Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprkP35822 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprkP35822 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtprkP35822 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PtprkP35822 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtprkP35822 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtprkP35822 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprkP35822 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PtprkP35822 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PtprkP35822 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PtprkP35822 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PtprkP35822 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PtprkP35822 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtprkP35822 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PtprkP35822 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms