Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms