Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rfc1P35601 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms