Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab17P35292 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab17P35292 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab17P35292 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab17P35292 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab17P35292 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab17P35292 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab17P35292 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab17P35292 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab17P35292 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab17P35292 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms