Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Ptpn11P35235 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn11P35235 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms