Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms