Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pola1P33609 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pola1P33609 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pola1P33609 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pola1P33609 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pola1P33609 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pola1P33609 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pola1P33609 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms