Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nedd1P33215 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms