Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rom1P32958 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rom1P32958 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rom1P32958 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rom1P32958 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rom1P32958 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rom1P32958 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rom1P32958 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rom1P32958 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rom1P32958 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rom1P32958 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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