Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms