Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Casp1P29452 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Casp1P29452 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Casp1P29452 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Casp1P29452 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Casp1P29452 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Casp1P29452 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Casp1P29452 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Casp1P29452 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Casp1P29452 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms