Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pabpc1P29341 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pabpc1P29341 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pabpc1P29341 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pabpc1P29341 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pabpc1P29341 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pabpc1P29341 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pabpc1P29341 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Pabpc1P29341 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pabpc1P29341 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pabpc1P29341 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pabpc1P29341 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pabpc1P29341 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pabpc1P29341 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pabpc1P29341 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pabpc1P29341 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pabpc1P29341 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pabpc1P29341 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pabpc1P29341 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pabpc1P29341 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pabpc1P29341 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pabpc1P29341 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pabpc1P29341 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pabpc1P29341 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pabpc1P29341 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pabpc1P29341 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pabpc1P29341 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pabpc1P29341 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pabpc1P29341 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pabpc1P29341 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pabpc1P29341 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pabpc1P29341 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pabpc1P29341 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pabpc1P29341 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pabpc1P29341 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pabpc1P29341 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pabpc1P29341 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pabpc1P29341 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pabpc1P29341 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pabpc1P29341 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pabpc1P29341 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pabpc1P29341 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pabpc1P29341 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pabpc1P29341 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pabpc1P29341 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pabpc1P29341 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pabpc1P29341 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pabpc1P29341 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pabpc1P29341 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pabpc1P29341 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pabpc1P29341 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms