Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mmp3P28862 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mmp3P28862 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mmp3P28862 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mmp3P28862 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mmp3P28862 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mmp3P28862 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mmp3P28862 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mmp3P28862 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms