Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa3P28310 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa3P28310 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa3P28310 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa3P28310 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa3P28310 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms