Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms