Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gjb1P28230 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms