Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms