Protein–RNA interactions for Protein: P27548

Cd40lg, CD40 ligand, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd40lgP27548 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms