Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CftrP26361 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CftrP26361 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CftrP26361 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CftrP26361 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CftrP26361 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CftrP26361 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CftrP26361 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CftrP26361 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CftrP26361 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CftrP26361 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CftrP26361 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CftrP26361 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CftrP26361 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CftrP26361 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CftrP26361 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CftrP26361 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CftrP26361 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CftrP26361 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CftrP26361 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CftrP26361 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CftrP26361 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CftrP26361 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CftrP26361 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CftrP26361 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CftrP26361 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CftrP26361 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CftrP26361 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CftrP26361 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CftrP26361 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CftrP26361 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CftrP26361 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CftrP26361 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CftrP26361 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CftrP26361 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CftrP26361 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CftrP26361 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CftrP26361 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CftrP26361 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CftrP26361 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CftrP26361 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CftrP26361 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CftrP26361 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CftrP26361 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CftrP26361 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CftrP26361 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CftrP26361 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CftrP26361 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CftrP26361 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CftrP26361 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CftrP26361 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CftrP26361 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CftrP26361 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CftrP26361 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CftrP26361 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CftrP26361 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CftrP26361 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CftrP26361 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CftrP26361 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CftrP26361 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CftrP26361 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CftrP26361 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CftrP26361 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CftrP26361 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CftrP26361 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CftrP26361 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CftrP26361 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CftrP26361 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CftrP26361 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CftrP26361 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CftrP26361 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CftrP26361 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CftrP26361 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CftrP26361 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CftrP26361 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CftrP26361 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CftrP26361 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CftrP26361 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CftrP26361 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CftrP26361 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CftrP26361 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CftrP26361 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CftrP26361 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CftrP26361 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CftrP26361 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CftrP26361 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CftrP26361 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CftrP26361 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CftrP26361 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CftrP26361 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CftrP26361 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CftrP26361 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CftrP26361 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CftrP26361 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CftrP26361 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CftrP26361 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CftrP26361 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CftrP26361 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CftrP26361 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CftrP26361 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms