Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ctnna1P26231 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms