Protein–RNA interactions for Protein: P25119

Tnfrsf1b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf1bP25119 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms