Protein–RNA interactions for Protein: P24549

Aldh1a1, Retinal dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a1P24549 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Aldh1a1P24549 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh1a1P24549 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh1a1P24549 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh1a1P24549 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh1a1P24549 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh1a1P24549 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh1a1P24549 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh1a1P24549 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh1a1P24549 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh1a1P24549 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh1a1P24549 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh1a1P24549 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh1a1P24549 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms