Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd12P23812 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms