Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkchP23298 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PrkchP23298 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PrkchP23298 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkchP23298 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkchP23298 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkchP23298 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PrkchP23298 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PrkchP23298 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PrkchP23298 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms