Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja1P23242 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja1P23242 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja1P23242 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja1P23242 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja1P23242 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja1P23242 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gja1P23242 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gja1P23242 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gja1P23242 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gja1P23242 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms