Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PparaP23204 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PparaP23204 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PparaP23204 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PparaP23204 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PparaP23204 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PparaP23204 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PparaP23204 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PparaP23204 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PparaP23204 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PparaP23204 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PparaP23204 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PparaP23204 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PparaP23204 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PparaP23204 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PparaP23204 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PparaP23204 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PparaP23204 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PparaP23204 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PparaP23204 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PparaP23204 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PparaP23204 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PparaP23204 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PparaP23204 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PparaP23204 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PparaP23204 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PparaP23204 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PparaP23204 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PparaP23204 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PparaP23204 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PparaP23204 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PparaP23204 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PparaP23204 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PparaP23204 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PparaP23204 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PparaP23204 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PparaP23204 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PparaP23204 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PparaP23204 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PparaP23204 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PparaP23204 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PparaP23204 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PparaP23204 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PparaP23204 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PparaP23204 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PparaP23204 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PparaP23204 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PparaP23204 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PparaP23204 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PparaP23204 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PparaP23204 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PparaP23204 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PparaP23204 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PparaP23204 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PparaP23204 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PparaP23204 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PparaP23204 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PparaP23204 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PparaP23204 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PparaP23204 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PparaP23204 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PparaP23204 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PparaP23204 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PparaP23204 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PparaP23204 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PparaP23204 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PparaP23204 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PparaP23204 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PparaP23204 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PparaP23204 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PparaP23204 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PparaP23204 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PparaP23204 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PparaP23204 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PparaP23204 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PparaP23204 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PparaP23204 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PparaP23204 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PparaP23204 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PparaP23204 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PparaP23204 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PparaP23204 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PparaP23204 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PparaP23204 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PparaP23204 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PparaP23204 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PparaP23204 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PparaP23204 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PparaP23204 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PparaP23204 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PparaP23204 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PparaP23204 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PparaP23204 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PparaP23204 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PparaP23204 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PparaP23204 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PparaP23204 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PparaP23204 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PparaP23204 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PparaP23204 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms