Protein–RNA interactions for Protein: P21447

Abcb1a, Multidrug resistance protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1aP21447 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcb1aP21447 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcb1aP21447 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms