Protein–RNA interactions for Protein: P21237

Bdnf, Brain-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BdnfP21237 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BdnfP21237 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BdnfP21237 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BdnfP21237 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BdnfP21237 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BdnfP21237 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
BdnfP21237 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BdnfP21237 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BdnfP21237 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BdnfP21237 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BdnfP21237 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BdnfP21237 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BdnfP21237 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BdnfP21237 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BdnfP21237 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BdnfP21237 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BdnfP21237 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BdnfP21237 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BdnfP21237 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BdnfP21237 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BdnfP21237 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BdnfP21237 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BdnfP21237 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BdnfP21237 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BdnfP21237 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BdnfP21237 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BdnfP21237 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BdnfP21237 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BdnfP21237 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms