Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tnnc2P20801 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnc2P20801 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms