Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb9P20615 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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