Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ms4a2P20490 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms