Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms