Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms