Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a1P19437 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms