Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18528 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18528 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18528 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18528 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
P18528 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18528 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18528 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18528 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18528 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18528 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18528 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18528 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18528 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18528 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18528 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18528 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18528 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18528 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18528 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18528 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18528 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18528 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18528 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18528 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18528 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18528 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18528 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18528 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18528 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18528 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18528 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18528 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18528 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18528 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18528 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
P18528 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
P18528 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18528 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18528 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18528 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18528 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18528 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18528 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18528 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18528 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18528 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18528 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18528 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18528 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18528 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18528 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18528 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18528 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18528 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18528 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18528 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18528 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18528 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18528 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18528 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18528 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18528 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18528 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18528 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18528 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18528 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
P18528 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18528 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18528 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
P18528 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18528 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18528 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18528 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18528 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18528 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18528 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18528 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18528 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
P18528 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18528 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18528 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18528 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18528 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18528 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18528 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18528 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18528 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18528 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18528 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18528 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18528 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18528 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18528 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18528 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
P18528 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18528 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
P18528 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18528 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18528 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms