Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rag1P15919 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rag1P15919 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rag1P15919 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rag1P15919 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms