Protein–RNA interactions for Protein: P14427

H2-D1, H-2 class I histocompatibility antigen, D-P alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-D1P14427 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-D1P14427 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-D1P14427 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.7 ms